富硒肥的研究应用起步较晚，还没有普及。市面上富硒肥以多种形式存在，包括富硒生物有机肥、有机富硒液体肥、富硒专用肥、无机硒盐等等。其中以富硒生物有机肥料为佳。

无机富硒肥

无机肥为矿质肥料，易溶于水，被称为“速效性肥料”。一般以无机肥料为载体将硒酸钠、亚硒酸钠、硒矿粉等加入其中而制成。但无机硒从毒性分级上属剧毒，用其直接喷施生产富硒果品存在的安全隐患，与国家提倡的安全绿色生产理念相悖。过量的无机硒会致使植物生长受到抑制，从而出现减产和品质下降现象，进而影响到人体健康和生态环境。

有机富硒肥

有机富硒肥的种类较多，有氨基酸硒肥、腐植酸硒肥等。

生物富硒肥

是指利用生物技术制造的富含硒肥效的生物制剂，其有效成分可以是特定的活生物体、生物体的代谢物或基质的转化物等，这种生物体既可以是微生物，也可以是动、植物组织和细胞。

缓释富硒肥

采用特殊的方法对硒源进行加工，施用后有效成分缓慢释放出来，延长了肥效释放期，减少有效态硒在土壤中被吸附或固定，从而提高硒的利用率。

施用方法

每类富硒肥都有与植物相适应的施用量、适宜施肥时期和施用方法。常用的方法有叶面喷施法、土壤施法、水培施等。